(一)一般纳税人购进或销售货物(东北以外地区固定资产除外)通过铁路运输，并取得铁路部门开具的运输发票，如果铁路部门开具的铁路运输发票托运人或收货人名称与其不一致，但铁路运输发票托运人栏或备注栏注有该纳税人名称的(手写无效)，该运输发票可以作为进项税额抵扣凭证，允许计算抵扣进项税额。
(二)一般纳税人在生产经营过程中所支付的运输费用，允许计算抵扣进项税额。
(三)一般纳税人取得的国际货物运输代理业发票和国际货物运输发票，不得计算抵扣进项税额。
(四) 按照运输业务起运地征收营业税的原则，起运地在中国大陆境内的中港、中澳之间的公路、海运运费，可凭取得的运输发票上注明的运费金额计算抵扣进项税额。
(五)一般纳税人取得的项目填写不齐全的运输发票(附有运输清单的汇总开具的运输发票除外)不得计算抵扣进项税额。

（六）一般纳税人取得的汇总开具的运输发票，凡附有运输企业开具并加盖财务专用章或发票专用章的运输清单，允许计算抵扣进项税额。

（七）从2006年8月1日起，统一使用新版《公路、内河货物运输业统一发票》（以下简称《货运发票》）。《货运发票》必须采用计算机和税控器具开具，手写无效；应如实一次性填开，运费和其他费用要分别注明；打印信息不完整及打印信息与还原信息不符的，为无效发票，国税机关在审核进项税额时不予抵扣。

（八）增值税一般纳税人购买或销售免税货物所发生的运输费用，不得计算进项税额抵扣。

（九）增值税一般纳税人采取邮寄方式销售、购买货物所支付的邮寄费，不允许计算进项税额抵扣。

（十）增值税一般纳税人发生的运输费用，取得的货运定额发票，不允许计算进项税额抵扣。